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西湖大学周强实验室新冠肺炎研究再出成果
在首次成功解析了新型冠状病毒细胞表面受体ACE2的全长三维结构，以及新型冠状病毒表面S蛋白受体结合结构域与细胞表面受体ACE2全长蛋白复合物的三维结构后，西湖大学周强实验室在新冠研究方面再次取得了新成果。
西湖大学周强团队利用冷冻电镜解析了新冠病毒S蛋白与中和抗体4A8复合物的结构。该抗体是由陈薇院士团队从新冠康复病人的免疫细胞中筛选和鉴定，针对新冠病毒S蛋白的N端结构域，具有强病毒中和能力。
该工作为靶向S蛋白N端结构域的药物设计和治疗策略提供了基础。相关研究成果已于北京时间5月9日在预印版平台bioRxiv上线。
（A potent neutralizing human antibody reveals the N-terminal domain of the Spike protein of SARS-CoV-2 as a site of vulnerability
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.08.083964v1）
本次研究中，陈薇院士团队的研究人员从感染新型冠状病毒后康复病人的记忆B细胞和浆细胞中分离初筛抗体，获得了399种单克隆抗体。经过人体体外环境的抗原抗体亲和力检测，以及活病毒和假病毒（即无扩增能力，而保留了侵染能力的病毒）的中和实验后，发现抗体4A8具有强病毒中和能力，可以明显抑制病毒的活性。
随后，周强实验室利用冷冻电镜技术，解析了4A8抗体与新冠病毒S蛋白的高分辨率复合物结构，可以清楚的看到二者的相互作用界面。
新冠病毒S蛋白与单克隆抗体4A8复合物的冷冻电镜密度图(左)及结构图
研究显示，4A8抗体通过重链与新冠病毒S蛋白的氮端结构域（NTD）相结合。在复合物的结构中，他们解析了NTD结构域的3个柔性片段（意为构象容易发生变化的区域），在之前解析的新冠病毒S蛋白的结构中，这部分序列因为其柔性而未被解析。之后的结构分析发现，中和抗体4A8的可变区与其中的两个柔性片段相互作用，因而稳定了该部分结构。
S蛋白以三聚体形式存在，含有三个单体。每个S蛋白单体中的NTD都能被4A8结合，且相互作用界面并无差别。抗体的结合在空间上不会影响S蛋白受体结合区域（RBD）的位置及RBD与细胞表面受体ACE2的结合。
新冠病毒S蛋白的N端结构域（NTD）和4A8重链的相互作用界面密度示意图
此前，在针对新冠病毒的研究中，抗体设计、药物设计主要靶向新冠病毒S蛋白的RBD区域，鲜有针对S蛋白其它区域的靶向治疗策略。
看清4A8抗体与新冠病毒S蛋白的复合物结构，为靶向新冠病毒氮端结构域的药物设计和治疗策略提供了结构基础。同时，4A8作为一种抑制病毒侵染人体细胞能力较强的抗体，也可以和作用于新冠病毒S蛋白其他区域的抗体联合使用，从而提高新冠治疗的成功概率。
本次研究西湖大学生命科学学院博士后鄢仁鸿为共同第一作者。西湖大学生命科学学院特聘研究员周强为共同通讯作者。
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