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西湖大学研究团队近期科研成果一览
2024-08-14 13:57
西湖大学
作者:

  01

  2024年5月1日,西湖大学工学院朱博文团队以及合作者开发了一种人工脉冲视觉神经元,能够实现外部视觉信息的速率与时间融合编码。视觉神经元通过单片集成氧化铟(In2O3)突触光电晶体管和氧化铌(NbOx)莫特忆阻器构成,分别模拟了生物感光细胞和视网膜神经节细胞的功能。采用速率-时间融合(Rate and Time Fusion, RTF)编码方案的脉冲神经网络(SNN)可以通过模仿生物视觉提高人工视觉的处理效率。相关研究工作以“An artificial visual neuron with multiplexed rate and time-to-first-spike coding”为题发表于Nature Communications。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41467-024-48103-9

  02

  2024年5月2日,西湖大学理学院、人工光合作用与太阳能燃料中心段乐乐团队在Angew. Chem. Int. Ed.上发表了题为“[2+1] Cycloadditions Modulate the Hydrophobicity of Ni-N4 Single-Atom Catalysts for Efficient CO2 Electroreduction”的研究成果。研究团队通过[2+1]环加成反应实现了Ni-N4单原子催化剂的表面氟化,得到的超疏水Ni-N4-CF2催化剂在0.50 M KHCO3电解液中催化CO2还原时表现出近乎100%的FECO。该研究为Ni-N4 SACs的[2+1]环加成表面官能化提供了指导,为通过共价表面官能化修饰碳材料负载金属催化剂的微环境提出了新策略。

  论文链接:

  https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202405650

  03

  2024年5月2日,西湖大学医学院徐和平课题组与合作团队于Nature Immunology杂志发表题为"Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates"的研究论文。研究成果揭示了浆细胞形成的动态调控机制以及TIGIT分子的新功能。通过构建骨髓嵌合体小鼠等经典免疫学模型,他们的研究发现TIGIT缺陷型浆细胞的增殖能力以及抗体分泌能力出现了显著性的下降。这些研究结果表明作为抑制T细胞活化应答的受体分子,TIGIT反而具有促进浆细胞应答的细胞内在分子功能。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41590-024-01831-y

  04

  2024年5月5日,西湖大学工学院周南嘉团队提出了一种模块化策略设计挤出头,利用多材料直写工艺挤出具有可调控周期性结构的纤维,并用来制造具有空间可编程周期性结构的 3D 物体。该研究成果以“Multimaterial extrusion of programmable periodic filament structures via modularly designed extruder heads”为题发表Additive Manufacturing上。

  论文链接:

  https://doi.org/10.1016/j.addma.2024.104234

  05

  2024年5月6日,西湖大学理学院胡鹏飞课题组在JACS发表了题为“Divergent Synthesis of Scabrolide A and Havellockate via an exo-exo-endo Radical Cascade”的研究成果。研究团队利用高效的自由基串联环化,通过一个共同中间体,完成两个天然产物scabrolide A和havellockate的发散式合成,为呋喃丁烯内酯(降)西松烷型二萜类分子的合成提供了新的思路。

  论文链接:

  https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c03995

  06

  2024年5月9日,西湖大学理学院张鑫团队在JACS上发表了题为“lonic effect on the microenvironment of biomolecular condensates”的研究成果。研究团队运用荧光寿命成像技术,针对离子对生物凝聚体微环境的影响进行了定量分析,并进一步探究了离子对于多相凝聚体分层混溶状态以及凝聚体对生物分子招募的影响。该成果系统研究了不同种类离子对生物凝聚体微环境性质的影响,为细胞在响应环境变化时调控凝聚体微环境提供了潜在途径。

  论文链接:

  https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jacs.4c04036

  07

  2024年5月10日,西湖大学医学院郑钜圣团队与合作者于Gut发表了以肠道真菌与妊娠健康为主题的研究成果,题目为"Landscape of the gut mycobiome dynamics during pregnancy and its relationship with host metabolism and pregnancy health"。该研究基于大规模孕妇队列(4800例),整合膳食调查、临床检查以及真菌组、细菌组、代谢组等数据,全面描绘了影响肠道真菌组成与结构的影响因素及其在孕期的动态变化,并分析了肠道真菌与宿主代谢及妊娠健康的关联及潜在机制,从肠道真菌的角度为全面理解肠道微生物对健康妊娠的影响提供了重要见解。

  论文链接:

  https://gut.bmj.com/content/early/2024/05/09/gutjnl-2024-332260

  08

  2024年5月17日,西湖大学理学院严正课题组与合作者的研究成果以“Measuring the Boundary Gapless State and Criticality via Disorder Operator”为题,发表在Physical Review Letters上,并被选为编辑推荐。严正团队与合作者通过设计边缘的无序算符,成功提取了奇特的表面临界信息,并且验证了他们所提出的理论猜想。这一研究成果开辟了有效提取多模式耦合下场论信息的新路径,为表面临界和非局域测量等领域提供了新思路。

  论文链接:

  https://journals.aps.org/prl/abstract/10.1103/PhysRevLett.132.206502

  09

  2024年5月17日,西湖大学工学院杨健团队报道了首个同时具有pH诱导变色、pH诱导开启荧光和自毁行为的有机小分子高酞酸酐(HA),并利用其特性,将其与另外两种pH指示剂结合,开发了一种具有动态多维和多模式光学加密特性的CMY调色板,相关研究工作以“Harnessing the Duality of Bases Towards Controlled Color and Fluorescence”为题在线发表于Science Advances。

  论文链接:

  https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adn9692

  10

  2024年5月19日,西湖大学工学院袁鑫实验室提出了一种基于CNN-Transformer架构的高效、大尺度视频单曝光压缩成像重建算法EfficientSCI++。相关工作以“Hybrid CNN-Transformer Architecture for Efficient Large-Scale Video Snapshot Compressive Imaging”为题发表于计算机视觉顶刊International Journal of Computer Vision。

  论文链接:

  https://link.springer.com/article/10.1007/s11263-024-02101-y

  11

  2024年5月20日,西湖大学生命科学学院李波团队于 Nature Communications 发表题为"Area postrema neurons mediate interleukin-6 function in cancer cachexia"的文章。研究人员发现脑干AP为介导IL-6参与肿瘤恶病质的重要核团。循环系统内IL-6作用并激活AP神经元;敲低AP神经元内IL-6受体可缓解恶病质病症并延长寿命。该文章首次揭示肿瘤如何通过炎症因子作用于神经系统,进而引发恶病质,并阐释了相关靶点与多种疗法。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41467-024-48971-1

  12

  2024年5月22日,西湖大学工学院陆启阳研究员在国际期刊ACS Nano上以Nano Focus Article的形式发表了一篇题为“How to Correctly Analyze 2p X-ray Photoelectron Spectra of 3d Transition-Metal Oxides: Pitfalls and Principles”的教程(Tutorial)文章。该论文针对3d过渡金属氧化物(如Mn、Fe、Co、Ni等)的2p X射线光电子光谱(X-ray photoelectron spectroscopy, 下文简称XPS)的分析方法进行了深入探讨,指出了目前常用的分峰拟合和结合能位移方法在定量分析金属氧化态方面存在的问题,并建议使用基于电子结构的理论框架来重构从而理解2p XPS光谱的复杂性。

  论文链接:

  https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.4c03964

  13

  2024年5月31日,西湖大学理学院石航课题组在JACS发表了题为“Ruthenium/η5-Phenoxo-Catalyzed Amination of Phenols with Amines”的研究论文。石航团队针对已知钌催化剂吸电子能力弱而难以通过π配位活化苯酚的问题,发展了η5-phenoxo配位的二价钌催化剂,实现了钌催化苯酚与胺的脱水缩合胺化反应。

  论文链接:

  https://pubs.acs.org/doi/epdf/10.1021/jacs.4c02089

  14

  2024年5月31日,西湖大学生命科学学院贾洁敏团队在Journal of Cerebral Blood Flow & Metabolism发表题为"High-resolution vasomotion analysis reveals novel arteriole physiological features and progressive modulation of cerebral vascular networks by stroke"的研究论文,他们提出了一项全面系统的血管动力学分析算法,不仅仅描述了生理状况下小鼠脑动脉血管运动的基本特征,并实时记录分析(0-14 days)缺血性中风条件下小鼠脑动脉血管运动与脑血流遭遇的损伤及其恢复情况,最终通过转基因(ME-Linker)小鼠重新激活脑动脉的自发血管运动,实现最佳再灌注的同时改善神经损伤,以助于缺血性中风后脑血管的恢复。

  论文链接:

  https://doi.org/10.1177/0271678X241258576

  15

  2024年6月17日至6月21日,人工智能顶级会议CVPR 2024于美国西雅图举行。在CVPR 2024公布的录取结果中,西湖大学工学院人工智能方向的李子青实验室、王东林实验室、袁鑫实验室、蓝振忠实验室、刘沛东实验室、林涛实验室、于开丞实验室共有9篇成果入选,其中2篇入选Poster(Highlight)论文。除此之外,原发杰实验室有1篇论文被人工智能国际顶刊TPAMI录用。

  近期,第42届国际机器学习大会 ICML 2024 公布录用结果,组委会于9473 篇论文中录用了2609篇论文(中稿率为27.5%),据不完全统计,有12篇来自西湖大学工学院人工智能方向的高水平论文成功入选。12篇 ICML 2024 论文中,有2篇来自王东林实验室,10篇来自李子青实验室。研究成果涉及 Al for Science、强化学习、扩散模型、长序列建模、生物分子设计等的相关领域。

  16

  近日,第62届国际计算语言学年会(Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics,简称 ACL)公布了 ACL 2024 论文录用消息。西湖大学工学院人工智能方向共9篇论文被 ACL 2024 录用,其中3篇论文被 ACL 主会录用,6篇被 Findings of ACL 录用。ACL年会是计算语言学和自然语言处理领域国际排名第一的顶级学术会议,由国际计算语言学协会组织,每年召开一次,在中国计算机学会(CCF)推荐会议列表中被列为A类会议。2024年是第62届会议,将于8月11日至8月16日在泰国曼谷举行。

  17

  2024年6月8日,西湖大学理学院、人工光合作用与太阳能燃料中心孙立成团队在Angew. Chem. Int. Ed.上发表了题为“Poly(Dibenzothiophene-Terphenyl Piperidinium) for High-performance Anion Exchange Membrane Water Electrolysis”的研究成果。研究团队从阴离子交换膜(AEM)传质机理出发,基于增强Grotthuss传质机理的设计思路,开发了一种用于水电解的高性能阴离子交换膜,为AEM乃至其他离子交换膜的性能提升提供更多可能,加速了AEM电解水的产业化进程。

  论文链接:

  https://doi.org/10.1002/anie.202405738

  18

  2024年6月12日,西湖大学理学院、人工光合作用与太阳能燃料中心王涛实验室在Angew. Chem. Int. Ed.上发表了题为“Rational Understanding Hydroxide Diffusion Mechanism in Anion Exchange Membranes during Electrochemical Processes with RDAnalyzer”的研究成果。研究团队通过反应分子动力学模拟对氢氧根在AEM中的扩散机理进行了探究,通过自主开发的RDAnalyzer软件实现了不同扩散机理的高效解耦和拆分,最终得到了Free Vehicular、Free Grotthuss、Associated Vehicular和Associated Grotthuss四种机理对于氢氧根扩散速率的贡献。该工作为研究氢氧根在AEM中的扩散机制提供了理论新策略和机理分析新工具。

  论文链接:

  https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202403614

  19

  2024年6月17日,西湖大学生命科学学院蔡尚团队在Nature Communications杂志在线发表了以衰老和乳腺癌发生为主题的研究成果:“Progressive Senescence Programs Induce Intrinsic Vulnerability to Aging-related Female Breast Cancer”。这项工作在单细胞层面建立了乳腺干细胞在小鼠全生命周期自然衰老过程中的分子时钟,揭示了衰老干细胞的多态性及渐进性,同时构建了正常细胞经衰老进而癌化的潜在途径,阐明了衰老转化过程中的关键节点,并成功筛选到通过抑制衰老降低癌发几率的小分子抑制剂。该研究对降低衰老人群的乳腺癌发生率提供了理论框架及潜在的干预策略。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41467-024-49106-2

  20

  2024年6月17日,西湖大学工学院朱博文课题组和合作者提出了一种具有离子介导功能的化学响应脉冲神经元,用于模拟生物神经元的行为,为构建未来的生物混合神经网络提供了一种新的策略,相关研究工作以“An Ion-Mediated Spiking Chemical Neuron based on Mott Memristor”为题发表于Advanced Materials。

  论文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adma.202403678

  21

  近期,西湖大学工学院刘剀实验室与合作伙伴在Advanced Materials、Advanced Functional Materials以及Water Research发表三项研究成果。一方面,课题组通过研究微塑料(NMPs)类新污染物从陆地到河流系统的传输途径,发现重点管控全国部分区域可实现NMPs污染的有效控制;另一方面,通过研究熔融盐向单原子位点转化的形成机制,构建具有普适性的单原子催化剂(SACs)制备策略,用于环境与能源催化;并通过原位谱学、电化学手段阐明SACs加氢机制,实现二氧化碳向高价值化工原料高效转化。

  论文链接:https://doi.org/10.1016/j.watres.2024.121597

  论文链接:https://doi.org/10.1002/adma.202406380

  论文链接:https://doi.org/10.1002/adfm.202405835

  22

  2024年6月25日,西湖大学生命科学学院甄莹团队在PNAS Nexus杂志在线发表了萤火虫毒素的起源演化的研究成果:“Firefly toxin lucibufagins evolved after the origin of bioluminescence”。通过比对产生LBGs毒素的萤火虫和不产生毒素的萤火虫ATPα氨基酸序列,团队研究人员找到疑似的氨基酸耐受突变,它们会不同程度影响毒素和蛋白的结合,从分子耐受性角度解释了萤亚科萤火虫善假于毒的能力。

  论文链接:

  https://academic.oup.com/pnasnexus/article/3/6/pgae215/7695494

  23

  2024年6月19日,西湖大学理学院刘志常实验室在Angew. Chem. Int. Ed.上发表了题为“π-Diamond: A Diamondoid Superstructure Driven by π-Interactions”的研究成果。研究团队利用分子张力工程策略,构建了Z形三面板组装基元,仅利用纯π-相互作用实现了金刚石超结构的分层自组装。这一研究探索了非共价相互作用的新可能性,为功能化超结构的构筑和材料科学带来了新的发展前景。

  论文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202409507

  24

  2024年7月2日,西湖大学生命科学学院裴端卿实验室在Cell Discovery发表题为“Pig blastocyst-like structure models from embryonic stem cells”的研究论文,该研究建立了将猪胚胎干细胞诱导为类囊胚的技术体系,首次将猪胚胎干细胞诱导形成类囊胚模型。猪是重要的畜牧业动物,也是理想的疾病模型,更是人源化器官的潜在供体。该研究可为改善猪等家畜大动物的育种体系、加速优良品种培育的进程提供新的思路,为探究人-猪细胞间相互作用提供优良体外模型,有助于推进在猪体内产生人源器官的研究进程。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41421-024-00693-w

  25

  近期,机器人顶会RSS收录王东林实验室成果,该文提出了一种基于RL的快速在线自适应控制(RL2AC)策略,以增强未知环境下足式机器人运动的鲁棒性。通过在RL中加入了一个自适应的前馈补偿项,以应对各种不确定因素对RL策略的影响。该论文被国际机器人顶级会议Robotics: Science and Systems(RSS)接收(2024年全球仅收录135篇)。

  RSS 2024接收论文列表详见:https://roboticsconference.org/program/papers/

  26

  2024年7月1日,西湖大学工学院王睿团队以及合作者在Nature Photonics上发表题为“High-entropy hybrid perovskites with disordered organic moieties for perovskite solar cells”的研究成果。他们首次探索了有机组分在构建新型高熵材料中的潜力,成功开发了一系列高熵有机-无机杂化钙钛矿材料,并深入探索了高熵有机-无机杂化钙钛矿材料的结构特征,揭示了其独特的体系熵贡献机制,为新型高熵材料的研发提供了全新的理论基础,同时为进一步提高光伏器件的性能提供了全新的材料选择。

  论文链接:https://doi.org/10.1038/s41566-024-01468-1

  27

  2024年7月10日,在意大利拉奎拉举行的国际暗物质大会(IDM)上,XENON合作组发布了首次测量到太阳中微子的低能核反冲信号的结果。这些中微子来自太阳内部的核反应,即涉及硼元素的反应链。西湖大学理学院物理系李圣超团队代表西湖大学参加XENON暗物质实验国际合作组,是探测器刻度工作的责任单位。在XENONnT寻找太阳硼-8中微子的实验中,李圣超博士带领中外团队成员进行了对中微子核反冲信号的刻度研究。利用钇-铍源产生的光中子,这一研究确定了液氙在低动量转移下核反冲的信号特征,对理解接近探测器灵敏极限的微弱中微子信号提供依据,为此项突破成果作出显著贡献。

  28

  2024年7月15日,西湖大学工学院鞠峰团队以“Highly-Accurate Classification and Discovery of Microbial Protein Functions Using FunGeneTyper: An Extensible Deep Learning Framework”为题在Briefings in Bioinformatics在线发表研究成果。研究团队首次提出了一个兼具蛋白编码功能基因的精准分类与发现双重功能的可扩展深度学习框架 FunGeneTyper, 并以威胁人类健康的抗生素抗性基因(ARG)为例,利用该新框架开发了相应的ARG精准分类器ARGTyper,比现有工具表现出更好的ARG分类性能。研究团队进一步利用从不同生境获得的实际微生物宏基因组测序数据测试展示了该新框架在新的功能基因发现任务上的明显优越性,并通过迁移学习证明了该框架在细菌毒力基因(VFG)等其他类型功能基因的精准分类与发现方面具有普适性。

  论文链接:

  https://doi.org/10.1093/bib/bbae319

  29

  2024年7月16日,西湖大学理学院吴明轩团队在Angew. Chem. Int. Ed.上发表了题为“A Chemoselective Enrichment Strategy for In-Depth Coverage of the Methyllysine Proteome”的研究成果。研究团队开发了一种基于芳基重氮盐共价、高效且可逆标记单甲基化赖氨酸的方法,成功实现了在多种生物样本中对赖氨酸甲基化修饰进行广泛的富集和鉴定,极大地拓展了领域内对赖氨酸甲基化修饰的认知,并为进一步研究赖氨酸甲基化修饰提供了一种有效便捷的化学工具。

  论文链接:

  https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202408564

  30

  2024年7月16日,西湖大学理学院、人工光合作用与太阳能燃料中心孙立成实验室在Nature Communications发表题为“Closing Kok’s cycle of nature’s water oxidation catalysis”的研究成果。他们利用GPU加速的分子动力学模拟和量子化学计算,发现了天然水氧化催化剂的重构过程。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41467-024-50210-6

  31

  2024年7月23日,西湖大学生命科学学院裴端卿课题组在Nature Communications在线发表题为Engineering mouse cell fate controller by rational design的文章。尽管目前对染色质动态变化规律和功能已有较为深入的研究,但如何通过开发相应工具调节染色质可及性达到诱导细胞命运转变仍有待进一步阐明。该研究通过工程化改造转录因子调控染色质可及性实现细胞命运转变并阐明其作用机制。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41467-024-50551-2

  32

  近日,欧洲计算机视觉国际会议ECCV 2024公布了论文的收录结果。西湖大学工学院人工智能方向共16篇论文入选。ECCV,全称为European Conference on Computer Vision,即欧洲计算机视觉国际会议,是计算机视觉领域中最顶级的会议之一,与ICCV(International Conference on Computer Vision)和CVPR(Conference on Computer Vision and Pattern Recognition)并称为计算机视觉领域的“三大顶会”。

  33

  2024年7月29日,西湖大学生命科学学院裴端卿实验室在Nature Communications发表题为“Cell fate decision by a morphogen-transcription factor-chromatin modifier axis”的研究论文,该研究报道了“胞外形态发生素信号分子-核内转录因子-染色质重塑复合物”细胞命运调控新范式,提供了一种研究早期胚胎发育过程中Epiblast-Hypoblast细胞命运决定的体外模型,并且首次建立了小鼠iPrE(induced Primitive Endoderm)体外诱导新方法。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41467-024-50144-z

  34

  2024年7月29日,西湖大学生命科学学院蒋敏课题组在Nature Aging发表题为“Maternal age enhances purifying selection on pathogenic mutations in complex I genes of mammalian mtDNA”的研究论文。该文使用最新的线粒体基因组编辑工具DdCBEs,成功构建了两种与临床线粒体疾病病人致病位点同源的单点突变小鼠模型,均为呼吸链复合物I亚单位:m.2820 G>A(ND1)和m.12918 G>A(ND5)。通过对这两种小鼠模型的母源遗传模式的研究,发现了这两个突变位点在母系遗传过程中被强力纯化选择,即:高突变的妈妈能够生出远低于自身突变率的下一代。

  论文链接:

  https://www.nature.com/articles/s43587-024-00672-6

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